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南京大學地理與海洋科學學院碩士研究生招生自命題科目參考書目見下表：

科目代碼	科目名稱	參考書目
919	經濟學原理	《宏觀經濟學教程》沈坤榮、耿強、韓劍主編，南京大學出版社，2016年6月第3版；《現代西方經濟學原理》（第六版）劉厚俊編著，南京大學出版社；《微觀經濟學》梁東黎、劉東著，南京大學出版社；《微觀經濟理論-基本原理與擴展（第9版）》（中英文皆可）Walter Nicholson著，北京大學出版社或《微觀經濟理論-基本原理與擴展（第10版）》（中英文皆可）Walter Nicholson著，中國人民大學出版社。
813	自然地理學	《自然地理學》（第二版），楊達源主編，科學出版社，2012年。
814	人文地理學	《人文地理學導論》，顧朝林、張敏、甄峰等，科學出版社，2016年；《人文地理學導論：21世紀的議題》，彼得·丹尼爾斯等，南京大學出版社，2014年。
815	地理信息系統概論	《地理信息系統概論》（第三版）黃杏元等編著，高等教育出版社；《地理信息系統導論》，Kang-tsung Chang著，陳健飛等翻譯，科學出版社；《地理信息系統基礎原理與關鍵技術》，馬勁松編，東南大學出版社，2020。
816	海洋科學導論	《海洋學導論》，Alan P. Trujillo, Harold V.Thurman著，張榮華、李新正、李安春等譯，電子工業出版社，2017；《海洋科學導論》馮世筰、李鳳岐、李少菁，高等教育出版社，1999（2004重印）。
819	土地管理學	《土地經濟學》，黃賢金、張安錄主編，中國農業大學出版社，2016年；《土地利用規劃學》，彭補拙、周生路等編著，東南大學出版社，2014年；《土地經濟研究》（輯刊）（2014-2018年），南京大學出版社。
857	遙感概論	《遙感導論》梅安新等編著，高等教育出版社。
877	環境科學原理	《環境化學》，科學出版社，2018，王曉蓉、顧雪元編；《環境生物學》，高等教育出版社，孔繁翔主編。
2703	復試筆試：C語言（地圖學與地理信息系統、資源環境遙感專業筆試與上機考試）	《C語言程序設計》(第五版)譚浩強，清華大學出版社。